در توصیف نرم افزار جنیوس شاید به سادگی نتوان توضیح داد که چه کارهایی با این نرم افزار قابل انجام است و باید گفت چه کارهایی هست که این نرم افزار ممکن است قادر به انجام آن نباشد !!!

نرم افزار جنیوس یک نرم افزار همه کاره و همه فن حریف برای یک پژوهشگر زیست شناسی مولکولی است که می تواند تمام نیازهای یک پژوهشگر این حوزه را برطرف نماید. با این نرم افزار می توانید توالی های خود را از پایگاه های ژنومی دریافت کرده، با یکدیگر مقایسه کنید، پرایمر طراحی کنید، کلونینگ خود را شبیه سازی کنید، وکتور و پلاسمید های خود را از نظر تمام عملکردها بررسی کرده و یا حتی این نرم افزار می تواند نقشه خام وکتور را برای شما آنالیز کرده و تک تک قسمت های آن را نام گذاری یا انوتیت کند.

همچنین این نرم افزار قادر است فایل های خام توالی یابی را خوانده و بر اساس الگوریتم های خاص خود آنها را کنترل کیفی کند و بخش های بی کیفیت را از نتیجه توالی یابی حذف نماید. همچنین نرم افزار جنیوس توانایی مقایسه چند توالی ژنومی و پروتئینی را داشته و می تواند برای شما درخت فیلوژنتیک را بر اساس انواع الگوریتم های استاندارد رسم کند.

نرم افزار جنیوس شما را در بخش پروتئین تنها نخواهد گذاشت و از آنالیز ساختارهای پلی پپتیدی و نمایش مشخصات آنها تا نمایش ساختارهای سه بعدی پروتئین در خدمت شما خواهد بود.

نویسنده: sziaee
نظرات: بدون نظر

طراحی الگوریتم ها و سیستم های بروز با تکنولوژی های نو یا همان Cut-Edge از اهمیت بسیار زیادی برخوردار است، این مسئله در تمامی علوم با مشکل ایجاد کردن همواره راه را برای تحقیقات پیشرفته بسته بود. اما نرم افزار CLC Genomics Workbench یک نرم افزار با رابط کاربری گرافیکی است که استفاده از آن را برای کاربر ساده تر می سازد . این نرم افزار برای تجزیه و تحلیل و تجسم داده ها شامل تکنولوژی cutting-edge و الگوریتم ، مناسب است . از مزایای نرم افزار می توان به طراحی و پیاده سازی الگوریتم های متعدد و مختلف، در کنار بهره گیری از الگوهای متفاوت و متناسب با نیاز کاربر اشاره کرد. این ابزار یکی ابزار مولتی پلتفرمی است که برای سیستم عامل های ویندوز ، مک و لینوکس ارائه شده است و شامل تعدادی از ویژگی های مختلف و مفید در زمینه های genomics، transcriptomic و epigenetics می باشد ؛ علاوه بر این برنامه شامل تمام ابزار های CLC Main Workbench نیز است . نرم افزار به دلیل بهره گیری از الگوهای دامنه ایی متعدد به کاربر اجازه میدهد که بتواند شرایط طراحی و الگوهای خود را پیاده سازی کند.

ویزگی های نرم افزار CLC Genomics Workbench:

-رابط کاربری ساده

-بهره از تکنولوژی های مدرن

-چند کاربرده بودن

-ارائه بر چندین پلتفرم

-قابلیت ارائه مدل های کاری مختلف

نویسنده: sziaee
نظرات: بدون نظر

Chromas در ابتدا با هدف اصلی تجزیه و تحلیل نتایج حاصل از توالی یابی یا سکوئنسینگ به بازار عرضه شد و با توجه به عدم وجود نرم افزارهایی برای خواندن فایل های خام توالی یابی به سرعت در بین پژوهشگران گسترش پیدا کرد. درست است که نرم افزار کروماس در ذهن های ما حالتی نوستالژیک داشته اما این نرم افزار نیز از چرخه رو به رشد نرم افزارها عقب نمانده و امکانات خود را گسترش داده و امکان مطالعه برخی خصوصیات ساده را به خود اضافه کرده اما همچنان به عنوان نرم افزاری برای باز کردن کلیه فایل های خروجی دستگاه های توالی یابی شناخته می شود.

البته این نرم افزار به صورت نسخه رایگان یا همان کروماس و نسخه کروماس پرو در وب سایت رسمی تولید کننده ارائه شده که در نسخه پرو برخی امکانات به ویژه امکان کنترل کیفی توالی ها و برش دادن بخش های کم کیفیت به صورت اتوماتیک به نرم افزار اضافه شده.

در صورت یافت نسخه پرو با کرک معتبر و غیر ویروسی حتما نسخه پرو نرم افزار نیز در وب سایت رایاژن ارائه خواهد شد.

برخی از ویژگیهای این نرم افزار عبارتند از:

  • کار با توالی‌های DNA و RNA
  • باز کردن فرمتهای SCF فایلهای کروماتوگرام ساخته شده توسط ALF, Li-Cor, VGO, Beckman CEQ 2000XL
  • باز کردن فایلهای کروماتوگرام از بیوسیستمها و دستگاه‌های Amersham MegaBace
  • قابلیت چاپ کروماتوگرام با امکاناتی برای بزرگ‌نمایی و جابجایی صفحه
  • امکان ذخیره توالی‌ها با فرمت SCF و فرمتهای بیوسیستمهای دیگر
  • صدور توالی‌ها در قالب فرمتهای Text, Fasta, EMBL, GenBank, GCG
  • امکان کپی توالی‌ها در کلیپ‌بورد و درج آن در برنامه‌های دیگر
  • کپی تصویر از بخشی از کروماتوگرام و درج در اسناد دیگر
  • جستجوی زیر توالی‌ها با خواص تطبیقی یا هم‌ترازی مطلوب
  • انجام عملیات صدور و چاپ توالی‌ها به صورت دسته‌ای
  • معکوس‌سازی و تکمیل توالی و کروماتوگرام
  • نمایش ترجمه‌ها در 3 فریم به همراه توالی
  • حذف خودکار توالی‌های با کیفیت پایین
  • نمایش فایلهای ژنوتیپ Genescan
  • و …
نویسنده: sziaee
نظرات: بدون نظر

رزرو تبلیغات در این مکان

مطالب بر اساس


رزرو تبلیغات در این مکان

نرم افزار های ضروری