Chromas در ابتدا با هدف اصلی تجزیه و تحلیل نتایج حاصل از توالی یابی یا سکوئنسینگ به بازار عرضه شد و با توجه به عدم وجود نرم افزارهایی برای خواندن فایل های خام توالی یابی به سرعت در بین پژوهشگران گسترش پیدا کرد. درست است که نرم افزار کروماس در ذهن های ما حالتی نوستالژیک داشته اما این نرم افزار نیز از چرخه رو به رشد نرم افزارها عقب نمانده و امکانات خود را گسترش داده و امکان مطالعه برخی خصوصیات ساده را به خود اضافه کرده اما همچنان به عنوان نرم افزاری برای باز کردن کلیه فایل های خروجی دستگاه های توالی یابی شناخته می شود.

البته این نرم افزار به صورت نسخه رایگان یا همان کروماس و نسخه کروماس پرو در وب سایت رسمی تولید کننده ارائه شده که در نسخه پرو برخی امکانات به ویژه امکان کنترل کیفی توالی ها و برش دادن بخش های کم کیفیت به صورت اتوماتیک به نرم افزار اضافه شده.

در صورت یافت نسخه پرو با کرک معتبر و غیر ویروسی حتما نسخه پرو نرم افزار نیز در وب سایت رایاژن ارائه خواهد شد.

برخی از ویژگیهای این نرم افزار عبارتند از:

  • کار با توالی‌های DNA و RNA
  • باز کردن فرمتهای SCF فایلهای کروماتوگرام ساخته شده توسط ALF, Li-Cor, VGO, Beckman CEQ 2000XL
  • باز کردن فایلهای کروماتوگرام از بیوسیستمها و دستگاه‌های Amersham MegaBace
  • قابلیت چاپ کروماتوگرام با امکاناتی برای بزرگ‌نمایی و جابجایی صفحه
  • امکان ذخیره توالی‌ها با فرمت SCF و فرمتهای بیوسیستمهای دیگر
  • صدور توالی‌ها در قالب فرمتهای Text, Fasta, EMBL, GenBank, GCG
  • امکان کپی توالی‌ها در کلیپ‌بورد و درج آن در برنامه‌های دیگر
  • کپی تصویر از بخشی از کروماتوگرام و درج در اسناد دیگر
  • جستجوی زیر توالی‌ها با خواص تطبیقی یا هم‌ترازی مطلوب
  • انجام عملیات صدور و چاپ توالی‌ها به صورت دسته‌ای
  • معکوس‌سازی و تکمیل توالی و کروماتوگرام
  • نمایش ترجمه‌ها در 3 فریم به همراه توالی
  • حذف خودکار توالی‌های با کیفیت پایین
  • نمایش فایلهای ژنوتیپ Genescan
  • و …
نویسنده: sziaee
نظرات: بدون نظر

نرم افزار بیوادیت یکی از نرم افزارهای ساده و آسان برای ویرایش توالی های زیستی و نتایج حاصل از مقایسه یا الاینمنت توالی ها است که توسط یک دانشجوی فارغ التحصیل علوم زیستی و به جهت افزایش سهولت ویرایش توالی ها نوشته شده است. به گفته شرکت سازنده این نرم افزار به شما امکان ویرایش توالی ها و برخی ویژگی های پایه و برخی امکانات ساده آنالیزی را ارائه می کند و به عنوان یک برنامه رایگان می توان از آن در چنین مواردی بهره برد. اما با نگاهی دقیق تر به این نرم افزار متوجه خواهید شد که بر خلاف ادعای ساده نویسنده شما با یک نرم افزار تمام عیار و توانمند روبرو هستید که می تواند به شما امکانات بی شماری را ارائه دهد.

این نرم افزار امکان باز کردن فرمت های مختلف توالی های زیستی از جمله فرمت های استاندارد بانک ژن مانند GB، GEN، GNK ، GBK و فرمت های استاندارد FASTA، فرمت های الاینمنت PIR و NBR، فرمت های Clustal ، phylip و بسیاری از فایل های مرتبط با توالی و الاینمنت را داشته و به عنوان یک ابزار سریع و ساده وجود آن بر روی کامپیوتر شما مفید خواهد بود. با داشتن بیوادیت شما هیچ فرمت نا آشنای زیستی بر روی کامپیوتر خواد نخواهید داشت. این نرم افزار هر توالی ای را برای شما باز خواهد کرد.

امکانات این نرم افزار به اندازه ای گسترده است که نمی توان از تک تک آنها نام برد اما شاید برای شما جالب باشد که بدانید بیوادیت با تمام پایگاه های داده توالی های زیستی امکان ارتباط دارد و با توجه به رایگان بودن آن شما در حین استفاده مشکلی از بابت لایسنس نرم افزار نخواهید داشت.

بیوادیت را می توانید جهت ساخت قطعات مکمل از روی توالی خود، آنالیز مشخصات پرایمر ها، بررسی نقاط برش آنزیم های برش دهنده و حتی مقایسه توالی ها استفاده کرد. در بخش توالی های پروتئینی هم این نرم افزار بسیار کامل و مفید خواهد بود.

پیشنهاد می کنیم این نرم افزار را دانلود و نصب نموده و از دیدن امکانات بی نظیر آن ساعت ها استفاده کنید. این نرم افزار به صورت رایگان بوده و شما می توانید از وب سایت رایاژن و یا از وب سایت رسمی خود نرم افزار آن را دانلود نمایید.

نویسنده: sziaee
نظرات: بدون نظر

نرم افزار ImageJ برای طیف گسترده ای از آنالیز های تصویر قابل استفاده است. این نرم افزار در زیست شناسی برای آنالیزهای تصاویر در آزمایشات زیست شناسی سلولی و یا ملکولی کاربردهای متعددی دارد.

نرم افزار Imagej در آنالیز ژل می تواند در موارد زیر برای ما کاربرد داشته باشد :

– برسی نحوه توزیع باند های تشکیل شده در ژل
– بررسی میزان بیان پروتئین (در ژل الکتروفورز)
– اندازه گیری میزان DNA در نمونه
-بررسی میزان کمیت هر باند
-محاسبه درصد بیان پروتئین ها
-بررسی میزان قطر و رنگ باندها
– بهبود کیفیت عکس های اصلی

در این فیلم یکی از پژوهشگران حوزه زیست شناسی نحوه آنالیز ژل را با استفاده از نرم افزار ImageJ آموزش می دهند.

متاسفانه کیفیت صدای فیلم ضبط شده بسیار پایین و همراه با نویز بوده اما توضیحات فیلم ارزشمند بوده و توصیه می شود این فیلم را دانلود و مشاهده نمایید.

 

همچنین نرم افزار ImageJ را می توانید از لینک های زیر دانلود نمایید :

دانلود نرم افزار ImageJ 1.51 نسخه مستقل

دانلود نرم افزار ImageJ 1.51 نسخه مکینتاش

دانلود نرم افزار ImageJ 1.51 نسخه ویندوز

دانلود نرم افزار ImageJ 1.51 نسخه لینوکس

 

 

نویسنده: sziaee
نظرات: بدون نظر

رزرو تبلیغات در این مکان

مطالب بر اساس


رزرو تبلیغات در این مکان

نرم افزار های ضروری